Қалқанша безінің аурулары - ең көп таралған эндокринология аурулар. Көптеген гипо-және гиперфункциялардың себептері аутоиммундық аурулар болып табылады. ТТГ, T3 және FT4-тен басқа, аутоантиденелер деңгейлері диагностикалық маңызды параметрлер болып табылады. Тиреоглобулин (ТГ) белгісіз себептермен күшті аутоантиген болып табылады. 1дМ изотипінің ТГ спецификалық антиденелері дені сау адамдардың қанында жиі кездеседі. Тиреоглобулинге IgG антиденелері - аутоиммунды созылмалы тиреоидиттің белгісі (Хашимото түрі) болып табылады. АТТГ-ның (сондай-ақ анти-ТПО-ның) жоғары деңгейі Хашимото тиреоидитіне тән. Бұл антиденелердің деңгейі аурудың барысын бақылау кезінде мұқият өлшенеді. Сирек жағдайларда Хашимото тиреоидитінде және гипертиреоз кезінде анти-ТГ, анти-ТПО және a-RTSH жоғары деңгейлері байқалады. Анти-ТГ және анти-ТПО деңгейлері, әдетте, лимфоцитарлық инфильтрациясыз Базед ауруы кезінде төмендейді.