Антитела к тиреоидной пероксидазе - это аутоантитела, направленные против фермента апикальной части фолликулярных клеток, катализирующего йодирование тирозина в тиреоглобулине в процессе синтеза ТЗ и Т4.  Этот вид антител вовлечен в процессы деструкции тканей, связанные с гипотиреозами, наблюдающимися при тиреоидите Хашимото и атрофическом тиреоидите. АТ-ТПО наиболее чувствительный тест в лабораторной диагностике аутоимунных заболеваний щитовидной железы, являющихся основной причиной развития гипотиреоза и гипертиреоза. Появление АТ-ТПО обычно является первым свидетельством развития гипотиреоза вследствие тиреоидита Хашимото. АТ-ТПО, определяемые современными высокочувствительными методами, обнаруживаются у более чем 95 % пациентов с тиреоидитом Хашимото и примерно у 85 % пациентов с болезнью Грейвса. Высокий уровень АТ-ТПО ассоциируется с повышенным риском невынашивания плода при беременности. Выявление АТ-ТПО на ранних стадиях беременности рассматривается как индикатор риска развития послеродового тиреоидита.