Специфический серологический маркёр гепатита Е - антитела класса IgG. Эти антитела характерны для острого периода заболевания. Выявляются в крови после появления желтухи. Чувствительность теста (по данным серологического обследования пациентов с установленной виремией) составляет 93%. Отрицательный результат не исключает инфицирования вирусом гепатита Е или предшествовавшей экспозиции.

После перенесённого ВГЕ формируется достаточно устойчивый иммунитет, но в отличие от ВГА, он не пожизненный. Хронические формы заболевания и вирусоносительство не зарегистрированы.