Один из белков, ответственных за неспецифическую резистентность организма к бактериальным антигенам. Основными функциями его являются индукция перемещения лейкоцитов к месту воспаления, опсонизация («прилипание») к стенке бактерий, с целью усиления реакций фагоцитоза, активирование гранулоцитов с последующим выбросом из них большого количества биологически активных веществ. Также может повышать проницаемость сосудов, стимулировать продукцию нейтрофилами лейкотриенов. С3 компонент комплемента связан с развитием многих аутоиммунных заболеваний.