Clostridium difficile — бактерия, которая вызывает инфекционную диарею и псевдомембранозный колит. Чаще заражаются пациенты старшего возраста, пребывающие на лечении в стационаре и принимающие антибиотики. Под влиянием возрастных факторов, сопутствующих заболеваний и изменения микрофлоры кишечника в результате воздействия антибиотиков у таких пациентов снижается иммунитет к C. Difficile.

Возбудитель селится в толстом кишечнике. Некоторые штаммы никак себя не проявляют, другие же выделяют токсины, вызывающие заболевания ЖКТ. Существует два типа токсинов — А и В. Токсин В присутствует во всех патогенных штаммах бактерии, токсин А — лишь в некоторых. Оба токсина вызывают гибель клеток кишечника, воспалительный процесс и повреждение тканей, что ведет к диарее и колиту.

Токсин А в большей степени энтеротоксичен (провоцирует воспалительный процесс и повреждение слизистой оболочки кишечника), а токсин В — цитотоксичен (вызывает гибель клеток). Также известен бинарный токсин, увеличивающий патогенность возбудителя.