Заболевания щитовидной железы являются наиболее распространенными эндокринологическими заболеваниями. Причинами большинства гипо- и гиперфункций являются аутоимунные заболевания. Помимо ТТГ, T3 и FT4 уровни аутоантител являются наиболее важными диагностическими параметрами.

Тиреоглобулин (ТГ) по неизвестным причинам является сильным аутоантигеном. Специфические антитела к ТГ изотипа 1дМ часто обнаруживаются в крови здоровых людей. Антитела IgG к тиреоглобулину являются маркером аутоимунного хронического тиреоидита (типа Хасимото).

Высокие уровни АТТГ (а также анти-ТПО) характерны для тиреоидита Хашимото. Уровни этих антител тщательно измеряют во время наблюдения за ходом болезни.

В редких случаях при тиреоидите Хашимото и гипертиреозе наблюдаются высокие уровни анти-ТГ, анти-ТПО и a-RTSH. Уровни анти-ТГ и анти-ТПО обычно понижены при Базедовой болезни без лимфоцитарной инфильтрации.