Тиреоидты пероксидазаға антиденелер - бұл T3 және T4 синтезі кезінде тирозинді тироглобулинде йодтауды катализдейтін фолликулалық жасушалардың апикальды бөлігінің ферментіне қарсы бағытталған аутоантиденелер.  Антидененің бұл түрі Хашимото тиреоидитінде және атрофиялық тиреоидитте кездесетін гипотиреоздармен байланысты тіндердің жойылу процестеріне қатысады. АТ-ТПО гипотиреоз бен гипертиреоздың дамуының негізгі себебі болып табылатын аутоиммунды қалқанша безінің ауруларын зертханалық диагностикасында ең сезімтал тест. АТ-ТПО пайда болуы, әдетте, Хашимото тиреоидитіне байланысты гипотиреоздың дамуының алғашқы дәлелі болып табылады. Қазіргі заманғы жоғары сезімтал әдістермен анықталатын АТ-ТПО Хашимото тиреоидиті бар пациенттердің 95% - дан астамында және Грейвс ауруы бар пациенттердің шамамен 85% - ында кездеседі. АТ-ТПО-ның жоғары деңгейі жүктілік кезінде ұрықты көтере алмау қаупінің жоғарылауымен байланысты. Жүктіліктің ерте кезеңдерінде АТ-ТПО-ны анықтау босанғаннан кейінгі тиреоидиттің даму қаупінің көрсеткіші ретінде қарастырылады.