Для вирусной респираторной инфекции источником инфекции является человек с выраженными клиническими проявлениями болезни, со стертой формой заболевания, а также бессимптомный носитель. Механизм передачи инфекции — воздушно-капельный, контактный (через игрушки, предметы обихода).

Ведущее место в этиологии острых респираторных заболеваний занимают вирусы. Основная доля ОРВИ приходится на возбудителей, имеющих тропность к определенным отделам дыхательных путей, к которым относятся, в том числе вирусы гриппа, парагриппа, аденовирусы, риновирусы, коронавирусы, респираторно-синцитиальный вирус, а также не так давно открытые метапневмовирусы и бокавирусы. Практически все эти возбудители вызывают заболевания, сопровождающиеся симптомами воспаления слизистой оболочки дыхательных путей и выраженной интоксикацией. Клиническая картина ОРВИ имеет сходные проявления, но некоторые возбудители, такие как вирусы парагриппа, респираторно-синцитиальный вирус и аденовирусы, способны вызывать заболевания с тяжелым течением, с развитием осложнений, а у пациентов из группы риска (дети, пожилые люди, пациенты с иммунодефицитами) могут приводить даже к летальному исходу.

Метапневмовирус - РНК-содержащий вирус, открыт в 2001 году, распространен повсеместно, вспышки заболеваемости встречаются зимой и весной. У детей, пожилых и людей с иммунодефицитом метапневмовирусы пр водят к бронхиту, бронхиолиту и пневмонии, а также гриппоподобного синдрома.

Вирусы парагриппа - РНК-содержащие, включают в себя 4 типа. Клинически инфицирования вирусами 1-го и 2-го типа проявляются воспалением слизистой оболочки гортани (ларингит) и верхних отделов трахеи, часто осложняются развитием крупа (стеноз гортани). Вирус 3-го типа чаще вызывает поражение нижних дыхательных путей (бронхиолит и пневмония), особенно у детей и взрослых людей с ослабленным иммунитетом. Вирус 4-го типа выявляется редко, поражает верхние дыхательные пути, течение инфекции мягкое.

Аденовирусы – семейство ДНК-содержащих вирусов, в холодное время частота заболеваний аденовирусными инфекциями возрастает. Аденовирусная инфекция поражает респираторный тракт, глаза, желудочно-кишечный тракт и мочевыводящие пути. У людей с иммунодефицитом аденовирусы вызывают генерализованные инфекции, с вовлечением гастроинтестинального тракта, легких и нервной системы.

Энтеровирусная инфекция – это кишечное заболевание, которое провоцируют энтеровирусы. Они содержат РНК и размножаются в ЖКТ (желудочно-кишечном тракте). Чаще всего развитие заболевания вызывают вирусы Коксаки и полиомиелита. Энтеровирусная инфекция крайне опасна. Вирусы устойчивы к воздействию внешней среды, длительное время не гибнут, даже находясь в почве или воде. Заражение происходит через загрязненную воду или немытые и термически не обработанные продукты питания. С током крови он разносится по всему организму человека и поражает все органы, в том числе легкие и мозг. Поэтому при постановке диагноза энтеровирусная инфекция, к лечению стоит отнестись очень внимательно.

Для эффективного дифференцированного противовирусного лечения важна этиологическая диагностика ОРВИ. Достоверное выявление возбудителя возможно исключительно лабораторными методами. Современные исследования, связанные с респираторными вирусами, становятся все более активными на мировом уровне. В настоящее время для диагностики и мониторинга пациентов используются методы, основанные на выращивании вирусов в культуре или иммунологических методах, а также методы, основанные на амплификации вирусных генов и являющиеся более чувствительными. Эти методы применяются для диагностики аденовирусов, параинфлюэнцавирусов, метапневмовируса, а также энтеровирусов, связанных с кишечными инфекциями, в целях диагностики и мониторинга респираторных вирусных инфекций.

В отделяемом дыхательных путей (слизь, мокрота и т. д.), которое используется в качестве исследуемого материала, присутствуют погибшие эпителиальные клетки вместе с вирусными частицами. Принцип метода ПЦР основан на обнаружении в материале специфичных фрагментов генетического материала вируса (РНК или ДНК), его избирательном синтезе с образованием огромного числа копий, что позволяет их легко детектировать, в том числе визуально.